К началу Великой Отечественной войны в Уфе насчитывалось 60 промышленных предприятий, но большинство довольно мелкие. Крупными были паровозоремонтный завод, моторостроительный, и нефтеперерабатывающий. В годы Великой Отечественной войны в Уфу из западных районов СССР были эвакуированы десятки промышленных предприятий, некоторые государственные учреждения и научно-исследовательские институты, сотрудники Коминтерна, писатели Украины и прочие.
С первых дней Великой Отечественной войны уфимцы, как и вся страна, сплотились перед общей бедой. Практически вся промышленность города работала теперь на нужды фронта. Нефтеперерабатывающая отрасль наладила производство топлива для самолетов; хлопчатобумажный комбинат выпускал ткани для военного обмундирования, которое шилось на местных фабриках; паровозоремонтный завод перешел на обслуживание локомотивов и выпуск боеприпасов. Здесь на личные средства уфимцев были построены бронепоезда «Уфа», «Александр Невский», «Полководец Суворов» и «Салават Юлаев». Каждый третий советский танк заправлялся горючим уфимского производства, из 137 тысяч советских военных самолетов 97 тысяч летали с авиадвигателями, изготовленными на Уфимском моторостроительном заводе.
За годы Великой Отечественной выпуск промышленной продукции на предприятиях города вырос в пять раз. Невиданными темпами развивалось машиностроение, возникли новые отрасли — химическая, текстильная, электроламповая, витаминная. Превращению Уфы в крупнейший индустриальный центр Урала способствовало и то обстоятельство, что в первые годы войны сюда было эвакуировано около 50 предприятий со всех концов страны. Из районов, занятых врагом, прибывали учреждения науки, образования, культуры, здравоохранения; город принял более 100 тысяч эвакуированных. Получив мощный приток материальных, интеллектуальных и культурных сил, Уфа, при всем трагизме происходящего, переживала настоящий взлет. Город рос темпами, которые не могли быть предусмотрены никакими проектами. В шести уфимских вузах обучалось свыше 5 тысяч студентов. Лекции им читали столичные профессора; в театрах и домах культуры выступали знаменитые артисты, писатели, художники, мастера искусств. Несмотря на голод и нищету, город жил, работал, учил детей, хотя из 63 уфимских школ 56 были отданы под военные нужды.
Прославилась Башкирия и своей военной доблестью. Всю страну облетела весть о подвиге Александра Матросова и Минигали Губайдуллина, закрывших собой вражеские амбразуры; в небе громил фашистов легендарный летчик-штурмовик, дважды Герой Советского Союза Муса Гареев. Осенью 1941 года в Уфе были сформированы 361-я стрелковая дивизия, 74-я и 76-я кавалерийские дивизии, зимой 1941 — весной 1942 — 112-я и 113-я Башкирские кавалерийские дивизии, позднее 214-я стрелковая дивизия, отдельные артиллерийские и пулеметные части. Из Уфы в апреле 1942 года отправилась на фронт прославленная 112-я Башкирская кавалерийская дивизия под командованием полковника М.М. Шаймуратова. Ее ратные подвиги будут отмечены орденами Ленина, Красной Звезды, Суворова и Кутузова 2-й степени; 76 воинов дивизии удостоятся звания Героя Советского Союза… Республика проводила на фронт свыше 700 тысяч своих сыновей и дочерей. Почти половина из них пала смертью храбрых, более 200 тысяч воинов были награждены орденами и медалями.